Jan Glapiak urodził się 26 grudnia 1959 r. w Lesznie, sakrament chrztu św. przyjął w rodzinnej parafii w Górce Duchownej 10 stycznia 1960 r. Ukończył Szkołę Podstawową w Górce Duchownej oraz II Liceum Ogólnokształcące im. M. Kopernika w Lesznie.

W latach 1978-1984 studiował w Arcybiskupim Seminarium Duchownym i na Papieskim Wydziale Teologicznym w Poznaniu. Pracę magisterską pisał z dziedziny prawa kanonicznego.

Dnia 24 maja 1984 r. z rąk Arcybiskupa Jerzego Stroby przyjął święcenia kapłańskie w katedrze poznańskiej. Był wikariuszem w Wieleniu n. Notecią i w parafii pw. Matki Boskiej Częstochowskiej w Poznaniu.

W latach 1989-1993 odbył studia specjalistyczne z prawa kanonicznego na Uniwersytecie Nawarry w Pampelunie, uzyskując stopień naukowy doktora.

Po powrocie ze studiów ks. dr Jan Glapiak był wicedyrektorem Księgarni Świętego Wojciecha (1993-1995), ojcem duchownym w Arcybiskupim Seminarium Duchownym w Poznaniu (1995-1996), a następnie – w latach 1996-2002 – kanclerzem Kurii Metropolitalnej w Poznaniu. Był także rzecznikiem prasowym Kurii.

W latach 2002-2021 był przewodniczącym referatu prawnego, dyscypliny sakramentów i sakramentaliów Kurii Metropolitalnej. Pełnił funkcję Delegata Biskupa ds. ochrony dzieci i młodzieży. W 2001 r. został mianowany kanonikiem honorowym Kapituły Kolegiackiej, a w 2010 r. - kanonikiem gremialnym Kapituły Metropolitalnej w Poznaniu. Był archidiecezjalnym duszpasterzem wspólnot Żywego Różańca. Autor publikacji „Sakramenty i inne ważne sprawy”, „Praktyczny przewodnik po przepisach prawa kanonicznego”, a także przewodnika po sanktuarium w Górce Duchownej i książek o tematyce różańcowej.

Papież Franciszek 15 listopada 2021 r. mianował ks. Jana Glapiaka Biskupem Pomocniczym Archidiecezji Poznańskiej i przydzielił mu stolicę tytularną Bisica. Sakrę biskupią przyjął z rąk Biskupa Zdzisława Fortuniaka 19 grudnia 2021 r. Jest Wikariuszem Generalnym archidiecezji. 

Jego dewizą biskupią są słowa: „Ecce Mater tua” (Oto Matka twoja). W strukturach Konferencji Episkopatu Polski jest członkiem Rady Prawnej.